updates2023

Update 1.7 - citaties en geneesmiddelen

14 jan. 2023
Update 1.7 - citaties en geneesmiddelen

Vandaag is de start van update 1.7, welke georganiseerde wetenschappelijke referenties introduceert samen met meer farmacologische gegevens over geneesmiddelen. Verder zijn er nog drie grote wijzigingen gebeurd waar de gemiddelde bezoeker niets van zal merken, maar die toch veel tijd hebben gekost: (1) alle code is geüpdatet naar PHP 8.2, (2) de back-end van de reactieopslag is vernieuwd (sommige code was sinds 2018 niet aangeraakt), en (3) het systeem dat icoontjes op pagina's weergeeft is volledig herzien (een redelijk grote optimalisatie die al lang gepland was). Verder bevat de update zoals gewoonlijk ook allerlei bugfixes en kleinere verbeteringen.


Wetenschappelijke referenties

Er is een nieuw systeem toegevoegd voor het fatsoenlijk bijhouden van wetenschappelijke referenties. Op dit moment worden referenties in allerlei verschillende lijstjes, onder verschillende objecten en op verschillende manieren bijgehouden. Het is de bedoeling dit nu allemaal te verzamelen op één centraal punt en dit dus ook overal consistent op dezelfde manier weer te geven.

Aangezien het net nieuw is is het voorlopig alleen beschikbaar voor de vernieuwde farmacologische gegevens voor geneesmiddelen (zie onder). Het overzicht is hier te vinden, maar het systeem zal overal doorheen de app gebruikt worden waarbij een referentie relevant is. Het systeem staat ook toe om te zoeken op auteur, zie bijvoorbeeld /citations/regårdh.

Per verwijzing naar een referentie zal soms ook een subjectieve classificatie gegeven worden over de kwaliteit van de publicatie voor de geassociëerde waarde. Dus bijvoorbeeld een publicatie die niet aangeeft hoe ze bijvoorbeeld tot een bepaalde logP-waarde gekomen zijn, of verwijst naar ongepubliceerde gegevens, zal lager scoren dan een publicatie die specifiek de lipofiliciteit van een stof bestudeerde. Op deze manier zullen ook door software berekende waarden een eigen (lagere) classificatie krijgen.


Geneesmiddelen & farmacologie

De stoffendatabase is geüpdatet om ondersteuning van meer gedetailleerde biofarmaceutische gegevens op te slaan per stof, meer specifiek over geneesmiddelen en enzymen. Als deze gegevens over een stof beschikbaar zijn zullen deze op de stoffenpagina onder het kopje Farmacologie weergeven worden. Het gaat om gegevens zoals de ongebonden fractie in (bloed)plasma, constanten voor Michaelis-Menten kinetiek (Vmax en Km), en de nier- en/of galklaring. Zie bijvoorbeeld metoprolol of metformine, waarvoor al enkele van deze waarden zijn ingevuld.

Ten laatste kunnen geneesmiddelen op de app nu geclassificeerd worden volgens het BCS-systeem. Over tijd zal deze informatie voor verschillende geneesmiddelen in de database toegevoegd worden, zolang deze informatie beschikbaar is in de literatuur. Aangezien deze classificatie soms wat subjectief is kunnen ook wij geen volledig consistente classificatie garanderen. Wanneer een geneesmiddel in verschillende klassen gecategoriseerd wordt in de literatuur zullen wij ook een subjectieve keuze moeten maken over welke we gebruiken.